單細胞組學
在單細胞解析度下解析組織異質性，精準定義細胞亞群及其分化軌跡。
DNBELAB 單細胞 ATAC
DNBelab 單細胞 ATAC 測序技術為華大基因依託自主研發的 DNBelab C 系列建庫系統（含 C-TaiM4 液滴生成儀）與 DNBSEQ 測序平台打造的高通量表觀遺傳學技術，核心用於單個細胞層級解析染色質可及性分布，精準定位啟動子、增強子等開放染色質區域，揭示基因表達調控的表觀遺傳基礎。作為國產單細胞表觀組學技術標竿，其突破進口平台技術壟斷，兼具快速建庫、低污染、多模態相容的核心優勢，依託精密壓力驅動微流控技術，可實現數萬細胞核的高效捕獲與文庫製備，且能與單細胞轉錄組資料聯動分析，打破表觀狀態與基因表達的研究壁壘。該技術廣泛應用於發育生物學、衰老機制研究、腫瘤異質性解析、神經科學等領域。
原理介紹
DNBelab 單細胞 ATAC 測序技術基於「微流控捕獲—轉座酶介導片段化—專屬 Barcode 標記」核心邏輯，結合 DNB 文庫優勢實現高效精準的染色質可及性解析：透過 DNBelab C-TaiM4 單細胞液滴生成儀，將單個細胞核、Tn5 轉座酶反應體系及攜帶專屬細胞 Barcode 的凝膠珠包裹於油包水微滴中，確保每個微滴僅含一個細胞核。Tn5 轉座酶可特異性結合染色質開放區域，對其進行切割並插入測序接頭，實現染色質片段化與標記同步完成，整個細胞核分離與標記過程僅需 6 分鐘，大幅提升實驗效率。標記後的片段經擴增、DNB 文庫建構後，透過 DNBSEQ 測序平台完成高通量測序。藉由細胞 Barcode 將測序 reads 精準分配至對應單細胞，經基因體比對與峰值分析，定位每個細胞的開放染色質區域，結合轉錄因子基序富集與標的 gene 註釋，建構「染色質可及性—基因調控」關聯網絡，同時可與轉錄組資料聯動，實現表觀狀態與基因表達的精準映射。
文獻案例
《Nature communications》發表題為 "Multiomics and cellular senescence profiling of aging human skeletal muscle uncovers Maraviroc as a senotherapeutic approach for sarcopenia" 的研究論文。研究採集老年肌少症患者與健康族群的骨骼肌樣本，透過 DNBelab 單細胞 ATAC 測序同步解析染色質可及性與細胞衰老表型，結合轉錄組、蛋白組資料建構多組學關聯網絡。結果發現，肌少症患者肌肉中衰老相關細胞（SASP 陽性）比例顯著升高，其發炎路徑基因調控區域染色質可及性異常增強，且 CCR5 基因啟動子區域開放度與衰老細胞豐度呈正相關。進一步驗證表明，CCR5 抑制劑馬拉維若可顯著下調衰老相關基因調控區域的染色質可及性，減少衰老細胞累積，同時改善肌纖維功能相關基因的表觀調控狀態，緩解肌肉萎縮表型。該研究透過表觀組學視角明確馬拉維若的抗肌少症作用機制，彰顯 DNBelab 單細胞 ATAC 技術在衰老相關疾病藥物篩選與機制解析中的核心價值。
送樣標準
細胞濃度 1×10⁵–5×10⁶個/mL，體積≥1mL/份，無血清培養基重懸並添加 0.04% 牛血清白蛋白；4°C 冷藏運輸，避免震盪與反覆凍融；細胞活性≥85%，無紅血球、雜質聚團，嚴禁使用含 EDTA 緩衝液，細胞核懸液需新鮮製備。
重量≥0.1g/份（肌肉、腫瘤、臟器等），取材後立即置於專用組織保存液中，4°C 冷藏運輸（嚴禁冷凍），24 小時內送達；註明組織類型、部位及處理條件，避免組織壞死，適配間質豐富組織解離。
細胞量≥1×10⁶個/份（細胞株）、類器官重量≥0.05g/份；細胞株消化為單細胞懸液後 4°C 運輸，類器官置於保存液中冷藏運輸；註明培養條件、藥物干預或誘導分化資訊，確保細胞狀態穩定。
細胞沉澱≥5×10⁶個/份，用無 EDTA 專用凍存液梯度凍存，液氮保存後乾冰運輸；解凍後立即製備單細胞懸液，快速洗滌去除凍存液，全程低溫操作，凍存時間不超過 3 個月，細胞活性≥80%。
重量≥0.2g/份，取材後去除筋膜雜質，置於專用保存液中 4°C 冷藏運輸，12 小時內送達；註明採樣部位、年齡及健康狀態，避免機械損傷，適配衰老機制研究相關樣本。
交付內容
原始測序資料
Fastq 格式原始測序 reads、Barcode 分配統計資料、測序品質管制報告、峰值 Calling 原始資料及 DNB 文庫建構參數。
資料分析報告
涵蓋細胞聚類分析圖、各亞群染色質開放區域註釋結果、差異開放區域火山圖、轉錄因子基序富集分析、基因調控網絡建構及與轉錄組資料聯動分析結論。
常見問題
核心優化方向：一是確保細胞核活性≥85%，透過密度梯度離心去除死細胞與雜質；二是調整轉座酶濃度與反應時間，適配不同樣本類型的染色質特性；三是增加測序深度，提升低豐度開放區域的檢測靈敏度；四是嚴格控制樣本運輸與處理時間，避免染色質降解。
依託 DNBelab 平台多組學相容性，對同--樣本同步開展 ATAC 測序與單細胞轉錄組測序，透過共同的細胞 Barcode 實現資料精準關聯。資料分析時，將染色質開放區域與對應基因表達水準映射，預測調控標的 gene，建構「表觀調控—轉錄表達」因果鏈，同時利用轉錄組註釋結果優化 ATAC 資料的細胞分群準確性。
