轉錄組學
精準捕捉基因表現動態，揭示調控機制，為您還原不同實驗條件下基因的響應模式。
lncRNA 測序
長鏈非編碼RNA（long noncoding RNA, lncRNA）為一類長度超過200 nt的長鏈非編碼RNA，透過與DNA、RNA或蛋白質結合，於表觀遺傳、轉錄及轉錄後等層次調控基因表達。lncRNA測序針對有參考基因體樣品開展準確的lncRNA鑑定與lncRNA標的基因預測，同時提供測序資料中mRNA的分析，結果更全面，廣泛應用於醫學、農學研究領域。
原理介紹
利用高通量測序技術進行lncRNA測序及生物資訊分析，可快速準確地發現具重要調控功能的lncRNA，分析其與特定生物學過程的關係，深入探索lncRNA的功能及其表達調控機制，包含競爭結合miRNA的ceRNA調控機制，及對染色質結構（如增強子、啟動子、絕緣子）的一系列調控。取得Total RNA樣品進行rRNA去除、cDNA合成（鏈特異性建庫），加入fragmentation buffer將RNA打斷成250–300bp短片段，以六鹼基隨機引物合成一鏈cDNA；加入緩衝液、dNTPs與DNA polymerase I合成二鏈cDNA，利用AMPure XP beads純化雙鏈cDNA；末端修復加接頭，純化的雙鏈cDNA再進行末端修復、加A尾並連接測序接頭，用AMPure XP beads進行片段大小選擇，用USER酶降解含U的cDNA第二鏈，用AMPure XP beads進行片段大小選擇。
文獻案例
《Molecular Cancer》期刊上「Integrative Multi-Omics Analysis Reveals the lncRNA 60967.1–PLCD4–ATRA Axis as a Key Regulator of Colorectal Cancer Progression and Immune Response」的研究論文透過多組學分析（轉錄組、蛋白質體、代謝組）發現lncRNA 60967.1在CRC組織中顯著下調，其過表達可恢復腫瘤抑制基因PLCD4的表達，提高全反式視黃酸（ATRA）層次，進而增強IFN-γ誘導的凋亡、增加IFNGR1表達，部分逆轉IFN-γ抗性。於小鼠模型中，lncRNA 60967.1過表達促進免疫細胞浸潤，與抗PD-1治療協同抑制腫瘤生長。該研究揭示了lncRNA-代謝物-免疫微環境的調控網路，為CRC免疫治療提供新標的。
送樣標準
內臟組織、腦組織≥0.2g，脂肪、皮膚、骨頭、血管等其他組織≥0.4 g。
葉片、花≥0.2g，根、莖、種子等其他組織≥0.7 g。
≥5×10⁶個。
≥3ml（EDTA抗凝管）。
總量：≥1ug；濃度：≥50ng/uL。
交付內容
參考序列比對分析拼接
序列拼接組裝、lncRNA篩選、新預測lncRNA結構特徵分析。
表達層次分析
樣品間相關性分析、cis作用標的基因預測。
lncRNA標的基因預測
trans作用標的基因預測。
差異分析
差異表達層次分析、GO富集分析、功能富集分析、KEGG富集分析、差異表達基因的蛋白互作網路分析、可變剪接分析。
結構分析
融合基因分析、SNP/InDel分析。
常見問題
進行lncRNA測序分析對物種有以下要求：a. 物種為真核生物；b. 物種具有參考基因體，至少拼接至scaffold層次；c. 具有較為完整的註釋。
可以，關聯分析思路類似lncRNA和mRNA的關聯分析，即蛋白質體差異表達蛋白與差異表達lncRNA標的基因編碼蛋白的交集分析（聚類、功能富集）。
長鏈非編碼RNA建庫主要採去除rRNA、建構鏈特異性文庫，目前建庫較為穩定。適用於人、鼠、動植物等物種。
Tophat和Cufflinks（建構轉錄本）、Infernal（家族分類）、CPC（對轉錄本編碼能力進行預測）、Blast（比對）、SOAP（過濾實驗中未去除乾淨的rRNA，及lncRNA表達定量比對）。
可以，長鏈非編碼RNA建庫模式採去核糖體方式建庫，對所獲得的RNA進行打斷測序，相當於獲得全部RNA，即可進行環狀RNA表達情況的分析，可應用於分析各物種環狀RNA表達譜。
人標品：已知mRNA定量與qPCR定量斯皮爾曼係數達到0.88。
