代謝流

代謝流分析(metabolic flux analysis)透過穩定同位素示蹤結合質譜檢測,追蹤標記原子在代謝路徑中的流向與速率,定量刻畫中心碳代謝、胺基酸及脂質等代謝網絡的通量分佈,是代謝調控機制研究的核心工具。

原理介紹

代謝流(Metabolic Flux)分析利用穩定同位素示蹤技術(如 [U-13C] glucose、[1,2-13C] glucose),檢測下游代謝產物的同位素標記模式(質量分佈向量 MDV),從而推算化合物在代謝路徑中的流向和分佈,得到特定代謝路徑的活躍程度。常規代謝組學檢測的是靜態代謝物濃度,但代謝物累積既可能源於產量增加,也可能源於消耗減少;同位素標記的代謝流方法可直接追蹤代謝物流向。例如以 [1,2-13C] glucose 為示蹤劑:經糖解作用代謝時 2 個 13C 均進入丙酮酸(M+2 佔 50%);經戊糖磷酸路徑時 1 個 13C 以 CO2 排出(M+1 佔 50%),根據 M+0、M+1、M+2 同位素相對豐度即可粗略估算兩條路徑對葡萄糖消耗的貢獻。檢測採用 Thermo Q-Exactive plus 高解析度質譜聯用 Vanquish UPLC 系統(HILIC 層析管),並對天然穩定同位素豐度進行校正以獲得真實 MDV。

實驗流程

1

同位素標記

細胞/微生物培養或動物餵食含穩定同位素示蹤劑(如 [U-13C] glucose)的培養基/飼料,設置時間梯度採樣,追蹤代謝流向

2

樣品製備

樣本加冷萃取液(甲醇:乙腈:水=2:2:1)超音波處理後低溫離心取上清,組織樣本勻漿後冰上孵育再離心,獲得代謝物萃取液待後續處理

3

濃縮復溶

上清徹底凍乾後,測定前以甲醇水溶液充分復溶,經離心與過濾後轉入進樣瓶,確保進樣品質穩定,避免基質干擾影響譜圖品質,保障偵測重現性

4

LC-MS 檢測

以 UPLC 聯用高解析質譜檢測,採用 HILIC 層析管分離,定期進行儀器性能維護,保障資料品質穩定,獲取高品質代謝譜圖

5

資料分析

以專業軟體處理資料,計算質量分佈向量(MDV/MID),經天然同位素豐度校正獲得 Corrected MDV,用於後續通量計算

6

統計分析

同位素分佈差異分析(長條圖,t-test p < 0.05)、差異代謝物聚類分析(熱圖)等結果呈現,直觀展示通量變化,揭示代謝規律

送樣標準

樣本類型

動物組織、細胞、血漿/血清、尿液、腦脊髓液與植物、微生物樣本等。

組織樣本

送樣 80 mg(風險 50 mg);送樣重複數建議 ≥ 8。

血漿/血清

送樣 200 μL(風險 80 μL);血漿抗凝劑優先用肝素鈉。

細胞

需按標靶代謝標準提供足量細胞,具體根據同位素示蹤實驗設計諮詢售前。

保存與運輸

-80℃ 保存建議 3 年以內;分裝避免反覆凍融,乾冰運輸;液體樣本液氮速凍 2 min 再 -80℃ 保存。

交付內容

原始資料

質譜下機原始檔案(RAW 格式)、樣本資訊表、QC 與儀器校準記錄;

代謝物同位素分佈分析结果

各代謝物滯留時間、m/z、峰面積、MDV 及天然同位素校正後的 Corrected MDV 資料表;

同位素分佈差異分析结果

比較組 MDV 長條圖,t-test p<0.05 顯著性標註與差異代謝物列表;

差異代謝物聚類分析熱圖

基於 Corrected MDV 顯著差異代謝物的層次聚類熱圖(Z-score 標準化);

實驗品質控制

QC 樣本 RSD 分佈圖(RSD<30%,樣本數≥10 穿插 QC)與品質控制合格判定報告;

樣本資訊與分組資訊表

含時間點、示蹤劑類型(如 [U-13C] glucose)、生物學重複編號的完整樣本後設資料表;

結題報告

含完整方法描述、結果圖表與解讀的代謝流分析 PDF 報告及全部結果附件。

常見問題

常規代謝組學檢測的是靜態的代謝物濃度,而代謝流利用穩定同位素示蹤技術追蹤代謝物的流向和分佈(如同追蹤道路上的車流量),能反映特定代謝路徑的活躍程度,區分代謝物累積是產量增加還是消耗減少所致。

天然穩定同位素(如 13C、2H、17O)也會造成較高的質量數,測得的 M+1 可能來自 1 個 13C 標記、1 個 2H 或 1 個 17O 等多種情況的總和,因此必須校正元素的天然同位素豐度,才能獲得真實的質量分佈向量(Corrected MDV)。

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